Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H3Q13889 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2H3Q13889 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H3Q13889 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
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