Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXOSC2Q13868 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms