Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX39BQ13838 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX39BQ13838 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms