Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPBGQ13641 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPBGQ13641 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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