Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL2Q13617 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL2Q13617 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL2Q13617 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL2Q13617 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CUL2Q13617 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CUL2Q13617 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL2Q13617 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL2Q13617 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms