Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NAE1Q13564 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAE1Q13564 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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