Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SCGB2A2Q13296 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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SCGB2A2Q13296 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCGB2A2Q13296 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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SCGB2A2Q13296 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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SCGB2A2Q13296 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SCGB2A2Q13296 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCGB2A2Q13296 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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