Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGDRQ13258 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGDRQ13258 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTGDRQ13258 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGDRQ13258 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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