Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
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