Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CSTF3Q12996 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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