Protein–RNA interactions for Protein: Q11201

ST3GAL1, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1Q11201 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ST3GAL1Q11201 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ST3GAL1Q11201 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ST3GAL1Q11201 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL1Q11201 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms