Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT1Q10472 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GALNT1Q10472 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALNT1Q10472 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms