Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSM1Q08AH1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSM1Q08AH1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms