Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCK1Q08629 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCK1Q08629 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms