Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUDPQ08623 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUDPQ08623 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms