Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNK2Q07912 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNK2Q07912 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNK2Q07912 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms