Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC3A1Q07837 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC3A1Q07837 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms