Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 LINC00470-209ENST00000582862 424 ntTSL 1 (best)7.66□□□□□ -1.183e-10■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 LINC00470-206ENST00000581212 721 ntTSL 1 (best)7.66□□□□□ -1.183e-10■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)4.93□□□□□ -1.623e-10■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 CCDC84-203ENST00000526463 1295 ntTSL 1 (best)25.81■■□□□ 1.725e-7■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 CCDC84-202ENST00000524670 885 ntTSL 521.64■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 CCDC84-206ENST00000532132 1119 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 CCDC84-209ENST00000580556 562 ntTSL 315.44■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 CCDC84-205ENST00000528088 1482 ntTSL 213.65□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.542e-6■■■■■ 39.5
FMR1Q06787 PSMG4-208ENST00000454610 2323 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 39.5
FMR1Q06787 R3HDM1-215ENST00000483021 539 ntTSL 325.03■■□□□ 1.61e-6■■■■■ 39.4
FMR1Q06787 R3HDM1-213ENST00000463230 2241 ntTSL 216.06■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 39.4
FMR1Q06787 R3HDM1-208ENST00000438014 582 ntTSL 511.22□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 39.4
FMR1Q06787 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 39.4
FMR1Q06787 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 39.4
FMR1Q06787 R3HDM1-219ENST00000488035 502 ntTSL 35.01□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 39.4
FMR1Q06787 IQGAP1-212ENST00000560418 559 ntTSL 519.57■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 39.4
FMR1Q06787 CCT5-206ENST00000508451 555 ntTSL 213.19□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 39.2
FMR1Q06787 EIF4G1-234ENST00000478291 564 ntTSL 220■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 SMS-203ENST00000457085 931 ntTSL 531.24■■■□□ 2.595e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 SPACA6-205ENST00000572703 964 ntTSL 527.81■■■□□ 2.045e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 25e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-208ENST00000422409 798 ntTSL 227.57■■■□□ 25e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 25e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.815e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.55e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.445e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 SPACA6-208ENST00000573896 554 ntTSL 422.98■■□□□ 1.275e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 POFUT1-205ENST00000486717 959 ntTSL 222.72■■□□□ 1.235e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.195e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.055e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.055e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.595e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.425e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-213ENST00000566050 1270 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.395e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FUBP1-212ENST00000492405 668 ntTSL 317.43■□□□□ 0.385e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FUBP1-213ENST00000492724 583 ntTSL 317.43■□□□□ 0.385e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.335e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.265e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FUBP1-201ENST00000294623 2201 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.165e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.155e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.115e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-215ENST00000567539 556 ntTSL 415.66■□□□□ 0.15e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.085e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.015e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.15e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.245e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-208ENST00000562096 691 ntTSL 313.15□□□□□ -0.35e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 MTHFSD-219ENST00000625049 3623 nt12.71□□□□□ -0.385e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 SRRM2-216ENST00000573583 543 ntTSL 411.67□□□□□ -0.545e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 POLR1A-207ENST00000483538 593 ntTSL 411.07□□□□□ -0.645e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 59.02□□□□□ -0.975e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.115e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 FUBP1-210ENST00000488814 612 ntTSL 37.29□□□□□ -1.245e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 PABPC1-206ENST00000518293 608 ntTSL 36.71□□□□□ -1.345e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.655e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.76e-11■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-216ENST00000491799 733 ntTSL 324.02■■□□□ 1.443e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-211ENST00000463995 1024 ntTSL 523.4■■□□□ 1.343e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-209ENST00000462439 829 ntTSL 222.73■■□□□ 1.233e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-208ENST00000457042 853 ntTSL 522.09■■□□□ 1.133e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-210ENST00000463616 699 ntTSL 322.09■■□□□ 1.133e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-207ENST00000449966 825 ntTSL 321.28■■□□□ 13e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-203ENST00000442186 924 ntTSL 521.28■■□□□ 13e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-205ENST00000447436 963 ntTSL 520.62■□□□□ 0.893e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.843e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-204ENST00000446089 855 ntTSL 517.92■□□□□ 0.463e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-215ENST00000483715 1055 ntTSL 317.27■□□□□ 0.363e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 39.1
FMR1Q06787 ESYT1-204ENST00000548142 563 ntTSL 315.54■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 39
FMR1Q06787 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 222.02■■□□□ 1.118e-7■■■■■ 39
FMR1Q06787 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 SGTA-204ENST00000589251 637 ntTSL 317.88■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-214ENST00000639665 2090 ntTSL 527.66■■■□□ 2.024e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-211ENST00000639398 2127 ntTSL 527.31■■□□□ 1.964e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.74e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.454e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.454e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-209ENST00000639115 2524 ntTSL 524.04■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-217ENST00000640530 2426 ntTSL 523.63■■□□□ 1.374e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.264e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-219ENST00000640967 2569 ntTSL 520.83■□□□□ 0.924e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 38.7
FMR1Q06787 FLNA-205ENST00000415241 704 ntTSL 518.55■□□□□ 0.561e-19■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 PRKDC-204ENST00000521331 1087 ntTSL 219.42■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 LINC00923-202ENST00000503874 1460 ntTSL 1 (best)14.76□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 WDYHV1-207ENST00000523551 853 ntTSL 312.17□□□□□ -0.468e-8■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 WDYHV1-209ENST00000524254 764 ntTSL 310□□□□□ -0.818e-8■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 TMEM38B-204ENST00000435034 721 ntTSL 36.79□□□□□ -1.326e-7■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.756e-7■■■■■ 38.6
FMR1Q06787 TJP2-207ENST00000498204 643 ntTSL 29.57□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.216e-12■■■■■ 38.5
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 207.4 ms