Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID5AQ03989 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID5AQ03989 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID5AQ03989 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms