Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ERCC6Q03468 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
ERCC6Q03468 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC43.67■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
ERCC6Q03468 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC43.57■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
ERCC6Q03468 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
ERCC6Q03468 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms