Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR3Q03167 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGFBR3Q03167 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms