Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLH2Q02577 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NHLH2Q02577 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.2 ms