Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BDH1Q02338 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BDH1Q02338 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms