Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHDQ02161 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHDQ02161 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHDQ02161 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHDQ02161 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHDQ02161 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHDQ02161 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHDQ02161 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHDQ02161 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHDQ02161 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHDQ02161 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHDQ02161 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHDQ02161 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHDQ02161 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHDQ02161 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHDQ02161 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHDQ02161 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHDQ02161 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHDQ02161 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHDQ02161 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHDQ02161 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHDQ02161 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHDQ02161 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHDQ02161 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHDQ02161 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHDQ02161 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHDQ02161 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHDQ02161 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHDQ02161 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHDQ02161 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHDQ02161 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHDQ02161 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHDQ02161 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHDQ02161 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHDQ02161 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHDQ02161 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHDQ02161 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHDQ02161 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHDQ02161 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHDQ02161 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHDQ02161 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHDQ02161 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHDQ02161 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHDQ02161 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHDQ02161 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHDQ02161 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHDQ02161 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHDQ02161 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHDQ02161 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHDQ02161 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHDQ02161 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHDQ02161 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHDQ02161 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHDQ02161 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHDQ02161 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHDQ02161 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHDQ02161 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHDQ02161 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHDQ02161 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHDQ02161 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHDQ02161 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHDQ02161 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHDQ02161 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHDQ02161 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHDQ02161 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHDQ02161 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHDQ02161 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHDQ02161 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHDQ02161 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHDQ02161 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHDQ02161 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHDQ02161 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHDQ02161 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHDQ02161 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHDQ02161 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHDQ02161 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHDQ02161 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHDQ02161 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHDQ02161 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHDQ02161 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHDQ02161 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHDQ02161 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHDQ02161 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHDQ02161 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHDQ02161 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHDQ02161 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHDQ02161 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHDQ02161 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHDQ02161 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHDQ02161 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHDQ02161 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHDQ02161 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHDQ02161 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHDQ02161 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHDQ02161 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHDQ02161 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RHDQ02161 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHDQ02161 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHDQ02161 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHDQ02161 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms