Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIBQ01892 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIBQ01892 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms