Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXOSC10Q01780 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC10Q01780 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms