Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1Q01589 FCP1YMR277W 2199 nt5.67□□□□□ -1.5
SED1Q01589 GCG1YER163C 699 nt5.67□□□□□ -1.5
SED1Q01589 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.67□□□□□ -1.5
SED1Q01589 MDH1YKL085W 1005 nt5.67□□□□□ -1.5
SED1Q01589 RPL31BYLR406C 342 nt5.67□□□□□ -1.5
SED1Q01589 AIM34YMR003W 597 nt5.67□□□□□ -1.5
SED1Q01589 YBL112CYBL112C 318 nt5.67□□□□□ -1.5
SED1Q01589 SEC24YIL109C 2781 nt5.67□□□□□ -1.5
SED1Q01589 MCM5YLR274W 2328 nt5.66□□□□□ -1.5
SED1Q01589 YKL077WYKL077W 1179 nt5.66□□□□□ -1.5
SED1Q01589 YKL102CYKL102C 306 nt5.66□□□□□ -1.5
SED1Q01589 ITR1YDR497C 1755 nt5.65□□□□□ -1.5
SED1Q01589 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.65□□□□□ -1.5
SED1Q01589 RNH1YMR234W 1047 nt5.65□□□□□ -1.5
SED1Q01589 YMR252CYMR252C 405 nt5.65□□□□□ -1.5
SED1Q01589 SEC62YPL094C 825 nt5.65□□□□□ -1.5
SED1Q01589 PRB1YEL060C 1908 nt5.64□□□□□ -1.51
SED1Q01589 SPG1YGR236C 288 nt5.64□□□□□ -1.51
SED1Q01589 DRE2YKR071C 1047 nt5.64□□□□□ -1.51
SED1Q01589 YMR034CYMR034C 1305 nt5.64□□□□□ -1.51
SED1Q01589 CCR4YAL021C 2514 nt5.64□□□□□ -1.51
SED1Q01589 GGC1YDL198C 903 nt5.63□□□□□ -1.51
SED1Q01589 OM45YIL136W 1182 nt5.63□□□□□ -1.51
SED1Q01589 ERG8YMR220W 1356 nt5.63□□□□□ -1.51
SED1Q01589 TOD6YBL054W 1578 nt5.63□□□□□ -1.51
SED1Q01589 TRS31YDR472W 852 nt5.62□□□□□ -1.51
SED1Q01589 YSC83YHR017W 1158 nt5.62□□□□□ -1.51
SED1Q01589 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.62□□□□□ -1.51
SED1Q01589 TSR2YLR435W 618 nt5.62□□□□□ -1.51
SED1Q01589 TMA46YOR091W 1038 nt5.62□□□□□ -1.51
SED1Q01589 ERR1YOR393W 1314 nt5.62□□□□□ -1.51
SED1Q01589 ERR2YPL281C 1314 nt5.62□□□□□ -1.51
SED1Q01589 CTF3YLR381W 2202 nt5.62□□□□□ -1.51
SED1Q01589 YCR041WYCR041W 333 nt5.61□□□□□ -1.51
SED1Q01589 NUP84YDL116W 2181 nt5.61□□□□□ -1.51
SED1Q01589 HED1YDR014W-A 489 nt5.61□□□□□ -1.51
SED1Q01589 DOT1YDR440W 1749 nt5.61□□□□□ -1.51
SED1Q01589 CUE4YML101C 354 nt5.61□□□□□ -1.51
SED1Q01589 YLR112WYLR112W 420 nt5.6□□□□□ -1.51
SED1Q01589 MRPL23YOR150W 492 nt5.6□□□□□ -1.51
SED1Q01589 AFG2YLR397C 2343 nt5.59□□□□□ -1.51
SED1Q01589 HIS1YER055C 894 nt5.59□□□□□ -1.51
SED1Q01589 CBR1YIL043C 855 nt5.59□□□□□ -1.51
SED1Q01589 YKR045CYKR045C 552 nt5.59□□□□□ -1.51
SED1Q01589 MHT1YLL062C 975 nt5.59□□□□□ -1.51
SED1Q01589 IMD1YAR073W 1212 nt5.59□□□□□ -1.51
SED1Q01589 YNL092WYNL092W 1203 nt5.59□□□□□ -1.51
SED1Q01589 SNT309YPR101W 528 nt5.59□□□□□ -1.51
SED1Q01589 OSW2YLR054C 2175 nt5.59□□□□□ -1.52
SED1Q01589 CEM1YER061C 1329 nt5.58□□□□□ -1.52
SED1Q01589 TUF1YOR187W 1314 nt5.58□□□□□ -1.52
SED1Q01589 TFG2YGR005C 1203 nt5.58□□□□□ -1.52
SED1Q01589 PAC2YER007W 1557 nt5.58□□□□□ -1.52
SED1Q01589 CDC1YDR182W 1476 nt5.58□□□□□ -1.52
SED1Q01589 COQ1YBR003W 1422 nt5.57□□□□□ -1.52
SED1Q01589 AMN1YBR158W 1650 nt5.57□□□□□ -1.52
SED1Q01589 GPD2YOL059W 1323 nt5.57□□□□□ -1.52
SED1Q01589 FYV1YDR024W 486 nt5.57□□□□□ -1.52
SED1Q01589 URH1YDR400W 1023 nt5.57□□□□□ -1.52
SED1Q01589 SNF4YGL115W 969 nt5.57□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YRB2YIL063C 984 nt5.57□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YHK8YHR048W 1545 nt5.57□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YIL108WYIL108W 2091 nt5.56□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YDL177CYDL177C 513 nt5.56□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YDR187CYDR187C 519 nt5.56□□□□□ -1.52
SED1Q01589 ATP10YLR393W 840 nt5.56□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YMR122CYMR122C 375 nt5.56□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YBR027CYBR027C 333 nt5.56□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YHR020WYHR020W 2067 nt5.55□□□□□ -1.52
SED1Q01589 CHA1YCL064C 1083 nt5.55□□□□□ -1.52
SED1Q01589 MRPL28YDR462W 444 nt5.55□□□□□ -1.52
SED1Q01589 CUP2YGL166W 678 nt5.55□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.55□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YAR064WYAR064W 300 nt5.55□□□□□ -1.52
SED1Q01589 PPM2YOL141W 2088 nt5.54□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.54□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YER137CYER137C 447 nt5.54□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YLR463CYLR463C 552 nt5.54□□□□□ -1.52
SED1Q01589 YOR012WYOR012W 414 nt5.54□□□□□ -1.52
SED1Q01589 RRP9YPR137W 1722 nt5.54□□□□□ -1.52
SED1Q01589 COX10YPL172C 1389 nt5.54□□□□□ -1.52
SED1Q01589 GNP1YDR508C 1992 nt5.53□□□□□ -1.52
SED1Q01589 MTR3YGR158C 753 nt5.53□□□□□ -1.52
SED1Q01589 AIM2YAL049C 741 nt5.53□□□□□ -1.52
SED1Q01589 TAE1YBR261C 699 nt5.53□□□□□ -1.52
SED1Q01589 TDH2YJR009C 999 nt5.52□□□□□ -1.53
SED1Q01589 YML018CYML018C 1182 nt5.52□□□□□ -1.53
SED1Q01589 MAS1YLR163C 1389 nt5.52□□□□□ -1.53
SED1Q01589 CTF19YPL018W 1110 nt5.51□□□□□ -1.53
SED1Q01589 CCT8YJL008C 1707 nt5.51□□□□□ -1.53
SED1Q01589 UIP5YKR044W 1332 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 VMA3YEL027W 483 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 MSP1YGR028W 1089 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 YMR253CYMR253C 1245 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 IRC11YOR013W 471 nt5.5□□□□□ -1.53
SED1Q01589 SGF29YCL010C 780 nt5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.1 ms