Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DEFA6Q01524 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DEFA6Q01524 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms