Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1Q01196 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RUNX1Q01196 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms