Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1BQ00975 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms