Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4GALNT1Q00973 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4GALNT1Q00973 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4GALNT1Q00973 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B4GALNT1Q00973 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms