Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC5Q00444 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC5Q00444 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms