Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC1P78348 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC1P78348 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC1P78348 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC1P78348 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC1P78348 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC1P78348 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC1P78348 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC1P78348 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC1P78348 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC1P78348 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC1P78348 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC1P78348 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC1P78348 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC1P78348 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC1P78348 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC1P78348 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC1P78348 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC1P78348 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC1P78348 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC1P78348 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC1P78348 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC1P78348 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC1P78348 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC1P78348 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ASIC1P78348 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ASIC1P78348 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ASIC1P78348 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ASIC1P78348 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ASIC1P78348 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC1P78348 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms