Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA4AP68366 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBA4AP68366 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms