Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2IP63279 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2IP63279 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2IP63279 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms