Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTG2P63267 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG2P63267 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG2P63267 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG2P63267 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms