Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL11P62913 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL11P62913 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL11P62913 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL11P62913 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL11P62913 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL11P62913 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL11P62913 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL11P62913 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL11P62913 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL11P62913 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL11P62913 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL11P62913 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL11P62913 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL11P62913 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL11P62913 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL11P62913 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL11P62913 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL11P62913 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL11P62913 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL11P62913 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL11P62913 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL11P62913 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL11P62913 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL11P62913 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL11P62913 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL11P62913 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL11P62913 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL11P62913 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL11P62913 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL11P62913 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL11P62913 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL11P62913 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL11P62913 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL11P62913 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL11P62913 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL11P62913 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL11P62913 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL11P62913 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL11P62913 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL11P62913 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL11P62913 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL11P62913 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL11P62913 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL11P62913 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL11P62913 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL11P62913 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL11P62913 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL11P62913 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL11P62913 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL11P62913 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL11P62913 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL11P62913 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL11P62913 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL11P62913 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL11P62913 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms