Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP46P62068 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP46P62068 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP46P62068 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP46P62068 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP46P62068 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP46P62068 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP46P62068 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP46P62068 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP46P62068 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP46P62068 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP46P62068 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP46P62068 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP46P62068 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP46P62068 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP46P62068 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP46P62068 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP46P62068 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP46P62068 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP46P62068 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP46P62068 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP46P62068 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP46P62068 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP46P62068 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP46P62068 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP46P62068 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP46P62068 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP46P62068 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP46P62068 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP46P62068 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP46P62068 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP46P62068 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP46P62068 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP46P62068 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP46P62068 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP46P62068 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP46P62068 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP46P62068 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP46P62068 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP46P62068 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP46P62068 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP46P62068 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
USP46P62068 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP46P62068 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP46P62068 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP46P62068 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP46P62068 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP46P62068 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP46P62068 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP46P62068 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP46P62068 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP46P62068 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP46P62068 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP46P62068 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP46P62068 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP46P62068 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP46P62068 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP46P62068 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP46P62068 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP46P62068 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP46P62068 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP46P62068 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP46P62068 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP46P62068 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP46P62068 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP46P62068 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms