Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-21P61565 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVK-21P61565 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-21P61565 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms