Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB2AP61019 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB2AP61019 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms