Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVPABLB-1P60509 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVPABLB-1P60509 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms