Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3EP60228 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3EP60228 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3EP60228 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3EP60228 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms