Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB15P59190 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB15P59190 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB15P59190 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB15P59190 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB15P59190 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB15P59190 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB15P59190 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB15P59190 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB15P59190 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB15P59190 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB15P59190 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB15P59190 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB15P59190 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB15P59190 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB15P59190 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB15P59190 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB15P59190 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB15P59190 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB15P59190 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB15P59190 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB15P59190 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB15P59190 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB15P59190 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB15P59190 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB15P59190 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB15P59190 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB15P59190 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB15P59190 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB15P59190 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB15P59190 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB15P59190 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB15P59190 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB15P59190 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB15P59190 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB15P59190 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB15P59190 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB15P59190 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB15P59190 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB15P59190 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB15P59190 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB15P59190 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB15P59190 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB15P59190 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB15P59190 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB15P59190 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB15P59190 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB15P59190 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB15P59190 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB15P59190 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB15P59190 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB15P59190 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB15P59190 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB15P59190 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB15P59190 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB15P59190 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB15P59190 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB15P59190 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB15P59190 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB15P59190 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB15P59190 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB15P59190 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB15P59190 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB15P59190 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB15P59190 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB15P59190 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB15P59190 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms