Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF3P57682 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF3P57682 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF3P57682 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF3P57682 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF3P57682 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF3P57682 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF3P57682 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF3P57682 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF3P57682 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF3P57682 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF3P57682 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF3P57682 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF3P57682 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF3P57682 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF3P57682 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF3P57682 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF3P57682 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF3P57682 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF3P57682 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF3P57682 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF3P57682 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF3P57682 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF3P57682 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF3P57682 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF3P57682 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF3P57682 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF3P57682 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF3P57682 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF3P57682 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF3P57682 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF3P57682 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF3P57682 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF3P57682 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF3P57682 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF3P57682 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF3P57682 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF3P57682 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF3P57682 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF3P57682 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF3P57682 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF3P57682 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF3P57682 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF3P57682 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF3P57682 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF3P57682 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF3P57682 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF3P57682 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF3P57682 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF3P57682 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF3P57682 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF3P57682 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF3P57682 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF3P57682 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF3P57682 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF3P57682 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF3P57682 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF3P57682 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF3P57682 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF3P57682 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF3P57682 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF3P57682 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF3P57682 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF3P57682 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF3P57682 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF3P57682 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF3P57682 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF3P57682 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF3P57682 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF3P57682 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF3P57682 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF3P57682 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF3P57682 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF3P57682 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF3P57682 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF3P57682 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF3P57682 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF3P57682 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF3P57682 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF3P57682 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF3P57682 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF3P57682 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF3P57682 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF3P57682 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF3P57682 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF3P57682 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF3P57682 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF3P57682 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF3P57682 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF3P57682 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms