Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARL4CP56559 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL4CP56559 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARL4CP56559 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms