Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMO3P55854 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUMO3P55854 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms