Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HADHBP55084 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HADHBP55084 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HADHBP55084 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HADHBP55084 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HADHBP55084 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HADHBP55084 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HADHBP55084 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HADHBP55084 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HADHBP55084 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HADHBP55084 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HADHBP55084 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HADHBP55084 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HADHBP55084 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HADHBP55084 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HADHBP55084 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HADHBP55084 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HADHBP55084 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HADHBP55084 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HADHBP55084 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HADHBP55084 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HADHBP55084 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HADHBP55084 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HADHBP55084 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HADHBP55084 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HADHBP55084 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HADHBP55084 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HADHBP55084 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HADHBP55084 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HADHBP55084 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HADHBP55084 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HADHBP55084 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HADHBP55084 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HADHBP55084 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HADHBP55084 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HADHBP55084 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HADHBP55084 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HADHBP55084 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HADHBP55084 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HADHBP55084 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HADHBP55084 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HADHBP55084 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HADHBP55084 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HADHBP55084 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HADHBP55084 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HADHBP55084 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HADHBP55084 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HADHBP55084 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HADHBP55084 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HADHBP55084 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HADHBP55084 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HADHBP55084 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HADHBP55084 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HADHBP55084 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HADHBP55084 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HADHBP55084 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HADHBP55084 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HADHBP55084 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HADHBP55084 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HADHBP55084 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HADHBP55084 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HADHBP55084 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HADHBP55084 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HADHBP55084 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HADHBP55084 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HADHBP55084 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HADHBP55084 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HADHBP55084 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HADHBP55084 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHBP55084 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHBP55084 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHBP55084 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHBP55084 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHBP55084 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHBP55084 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms