Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2JP52435 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2JP52435 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2JP52435 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms