Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV1P50549 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV1P50549 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV1P50549 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV1P50549 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV1P50549 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV1P50549 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV1P50549 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV1P50549 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV1P50549 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV1P50549 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV1P50549 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV1P50549 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV1P50549 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV1P50549 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV1P50549 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV1P50549 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV1P50549 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV1P50549 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV1P50549 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV1P50549 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ETV1P50549 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ETV1P50549 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETV1P50549 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETV1P50549 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETV1P50549 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETV1P50549 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETV1P50549 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ETV1P50549 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETV1P50549 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETV1P50549 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETV1P50549 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETV1P50549 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETV1P50549 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETV1P50549 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETV1P50549 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETV1P50549 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETV1P50549 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETV1P50549 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETV1P50549 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETV1P50549 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETV1P50549 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETV1P50549 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETV1P50549 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETV1P50549 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETV1P50549 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ETV1P50549 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETV1P50549 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETV1P50549 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETV1P50549 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETV1P50549 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETV1P50549 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETV1P50549 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETV1P50549 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETV1P50549 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETV1P50549 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETV1P50549 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETV1P50549 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETV1P50549 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETV1P50549 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETV1P50549 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV1P50549 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV1P50549 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV1P50549 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV1P50549 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV1P50549 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV1P50549 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV1P50549 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV1P50549 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV1P50549 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV1P50549 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV1P50549 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV1P50549 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV1P50549 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETV1P50549 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETV1P50549 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETV1P50549 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV1P50549 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV1P50549 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV1P50549 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV1P50549 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV1P50549 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms