Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOPP49908 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENOPP49908 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SELENOPP49908 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENOPP49908 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENOPP49908 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENOPP49908 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms